scD增压
评估单细胞rna-seq数据表达变化的组成模型
生物导体版本：释放（3.19）
scDDboost是一个R包，用于分析两种实验条件下单细胞表达数据分布的变化。与其他评估差异表达的方法相比，scDDboost从细胞聚集成细胞亚型所传递的信息中受益匪浅。通过一种新的经验贝叶斯公式，它计算了基因特定的后验概率，即两种条件之间的边际表达分布相同（或不同）。scDDboost中的实现将每个条件下的基因级表达数据视为负二项分布的混合。
作者：马秀玉[cre，aut]，迈克尔·牛顿[ctb]
维护人员：马秀玉（Xiuyu Ma）<gmail.com上的watsonforfun>
引文（从R中输入引文（“scDDboost”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“scDDboost”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“scDDboost”）
细节
| 生物视图 |
贝叶斯主义者,群集,差异表达式,基因表达式,排序,单个单元格,软件 |
| 版本 |
1.6.0 |
| 自 |
生物柴油3.16（R-4.2）（2年） |
| 许可证 |
GPL（>=2） |
| 取决于 |
R（>=4.2），ggplot2 |
| 进口 |
卢比(>= 0.12.11),RcppEigen基因(>= 0.3.2.9.0),EB序列,生物并行,麦克卢斯特,单细胞实验,集群,奥斯科普,总结性实验，统计信息，方法 |
| 系统要求 |
c++11代码 |
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/wiscstatman/scDDboost |
| 错误报告 |
https://github.com/wiscstatman/scDDboost/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
