冲压机
阵列和NGS数据中罕见异常甲基化区域的检测
生物导体版本：释放（3.19）
ramr是一个R包，用于检测通过使用阵列或高通量亚硫酸氢测序进行甲基化分析获得的大数据集中的低频异常甲基化事件。此外，该软件包还提供了可视化发现的异常甲基化区域（AMR）的功能，生成所有可能区域的集合，用作富集分析的参考集，并生成生物相关的测试数据集，用于AMR/DMR搜索算法的性能评估。
作者：Oleksii Nikolaienko【aut，cre】
维护人员：Oleksii Nikolaienko在gmail.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“ramr”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“ramr”）
细节
| 生物视图 |
DNA甲基化,差异甲基化,表观遗传学,甲基Seq,甲基化阵列,软件 |
| 版本 |
1.12.0 |
| 在生物导体中 |
生物化学3.13（R-4.1）（3年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=4.1），基因组范围，平行，do并行,foreach公司,doRNG公司，方法 |
| 进口 |
I范围,生物遗传学,ggplot2,重塑2,环境统计,外部分发,矩阵统计,S4载体 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/BBCG/ramr |
| 错误报告 |
https://github.com/BBCG/ramr/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
