结合非参数方法的节律分析


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包使用非参数方法来检测时间序列中的节奏。它处理异常值、缺失值,并针对包含10-100个测量值的时间序列进行优化。由于它不假设预期有任何不同的波形,因此在基因组或蛋白质范围的生物测量(例如:微阵列、蛋白质组质谱或代谢组测量)中,它是最佳的或检测振荡行为(例如,昼夜节律或细胞周期)。

作者:Paul F.Thaben,保罗·O·韦斯特马克

维护人员:保罗·塔本(Paul F.Thaben)

引文(从R中输入引文(“rain”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“rain”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“雨”)
雨水使用 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 遗传学,微阵列,多重比较,蛋白质组学,软件,系统生物学,时间课程
版本 1.38.0
在生物导体中 生物技术3.0(R-3.1)(10年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=2.10),gmp公司,multtest公司
进口
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 雨1.38.0.tar.gz
Windows二进制 rain_1.38.0.zip
macOS二进制(x86_64) 雨_1.38.0.tgz
macOS二进制(arm64) 雨_1.38.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rain
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/雨水
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/rain/
包短Url https://bioconductor.org/packages/rain/
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