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rWikiPathways(维基路径)

rWikiPathways-用于WikiPathsways API的R客户端库


生物导体版本:释放(3.19)

使用此软件包与WikiPathways API接口。它提供了对多种数据和图像格式的WikiPathways内容的编程访问,包括官方每月发布文件和方便的GMT读/写功能。

作者:埃贡·威利加根[aut,cre],亚历克斯·皮科[aut]

维护人员:伊贡·威利加根(Egon Willighagen)<Egon.Willighagen at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“rWikiPathways”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“rWikiPathways”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“rWikiPathways”)
1.概述 HTML格式 R脚本
2.rWikiPathways和BridgeDbR HTML格式 R脚本
3.rWikiPathways和RCy3 HTML格式 R脚本
4.路径分析 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 图形和网络,代谢组学,网络,软件,第三方客户,可视化
版本 1.24.0
在生物导体中 生物技术3.7(R-3.5)(6年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于
进口 高温气冷堆,实用程序,XML格式,罗杰森,数据表,RCurl(RCurl),数字播放器,第三年,阅读器,字符串,呜呜声,杂交的
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/wikipathways/rwikipathys
错误报告 https://github.com/wikipathways/rwikipathys/issues
查看更多
建议 测试那个,仿生风格,针织物,rmarkdown公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我 法玛特,裂谷热(RVA)
建议我 特朗科
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 rWikiPathways_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 rWikiPathways_1.24.0.zip
macOS二进制(x86_64) rWikiPathways_1.24.0.tgz
macOS二进制(arm64) rWikiPathways_1.24.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rWikiPathways网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rWikiPathways
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/rWikiPathways(维基路径)/
包短Url https://bioconductor.org/packages/rWikiPathways网站/
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