r基因组轨迹

表观遗传学数据的整体可视化

生物导体版本：释放（3.19）

rGenomeTracks包利用了pyGenomeTrack软件的强大功能和R.pyGenomeTracks的交互性。pyGenomeTracks是一种python软件，提供了强大的方法来可视化表观遗传数据文件，如窄峰、Hic矩阵、TAD和弧，但是，目前无法在R交互会话中使用它。rGenomeTracks将pyGenomeTrack的整个功能与其他实用程序结合在一起，使R用户更加愉快。

作者：奥马尔·埃拉什卡[aut，cre]

维护人员：奥马尔·埃拉什卡尔（Omar Elashkar）

引文（从R中输入引文（“rGenomeTracks”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“rGenomeTracks”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“rGenomeTracks”）

r基因组轨迹	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式

需要帮助吗？请访问生物导体支持网站！

细节

生物视图	HiC公司,软件,可视化
版本	1.10.0
自	生物柴油3.14（R-4.1）（3年）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=4.1.0）
进口	成像仪,网状的、方法、，r基因组跟踪数据
系统要求	pyGenomeTracks（首选使用install_pyGenomeTrack（））
统一资源定位地址

建议	市场营销,针织物,测试那个(>= 3.0.0)
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	r基因组轨迹_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	r基因组轨迹_1.10.0.zip
macOS二进制（x86_64）	r基因组轨迹_1.10.0.tgz
macOS二进制（arm64）	rGenomeTracks_1.10.0.tgz基因轨迹
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rGenomeTracks网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/rGenomeTracks
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/r基因组追踪/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/rGenomeTracks网站/
软件包下载报告	下载统计信息