r3序列

染色体构象捕获和下一代测序（3C-seq）分析

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包用于分析3C-seq分析中的长程染色质相互作用。

作者：Supat Thongjuea，MRC WIMM计算生物学中心，英国牛津大学威瑟尔分子医学研究所<Supat.Thongjuea at imm.ox.ac.UK>

维护人员：Supat Thongjuea<在imm.ox.ac.uk上的Supat.Thongjuea>或在gmail.com>上的Supat.Thongjuea

引文（从R中输入引文（“r3Cseq”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“r3Cseq”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“r3Cseq”）

生物视图	预处理,排序,软件
版本	1.50.0
在生物导体中	BioC 2.9（R-2.14）（13年）
许可证	GPL-3公司
取决于	基因组范围,Rsamtools软件,无线电跟踪器,VGAM公司,q值
进口	方法，基因组信息Db,I范围,生物串,数据表,平方英尺,R彩色啤酒
系统要求
统一资源定位地址	http://r3cseq.genereg.net https://github.com/supatt-lab/r3Cseq/

建议	英国基因组。姆穆苏卢斯。UCSC.mm9.屏蔽,英国基因组。姆穆苏卢斯。UCSC.mm10.屏蔽,英国基因组。Hsapiens。UCSC.hg18.屏蔽,英国基因组。Hsapiens。UCSC.hg19.屏蔽,英国基因组。褐家鼠。UCSC.rn5.屏蔽
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	r3C当量_1.50.0.tar.gz
Windows二进制	r3Cseq_1.50.0.zip码
macOS二进制（x86_64）	r3Cseq_1.50.0.tgz
macOS二进制（arm64）	r3Cseq_1.50.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/r3Cseq
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/r3Cseq
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/r3Cseq/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/r3Cseq/
软件包下载报告	下载统计信息