pqsfinder（pqsfinder）

潜在四联体形成序列的识别

生物导体版本：释放（3.19）

Pqsfinder检测可能折叠成分子内G-四链体（G4）的DNA和RNA序列模式。与许多其他方法不同，pqsfinder能够检测从包含凸起或不匹配的不完美G-runs或具有长循环的G4折叠的G4。Pqsfinder还为G4测序数据上拟合的每个命中值分配一个整数分数，对应于折叠G4的预期稳定性。

作者：Jiri Hon、Dominika Labudova、Matej Lexa和Tomas Martinek

维护人员：Jiri Hon<gmail.comjiri.Hon>

引文（从R中输入引文（“pqsfinder”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“pqsfinder”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“pqsfinder”）

生物视图	基因调控,MotifDiscovery公司,序列匹配,软件
版本	2.20.0
在生物导体中	生物多样性3.3（R-3.3）（8.5年）
许可证	BSD_2_clause+文件许可证
取决于	R（>=3.5.0），生物管柱
进口	卢比(>= 0.12.3),基因组范围,I范围,S4载体，方法
系统要求	GNU品牌，C++11
统一资源定位地址	网址：https://pqsfinder.fi.muni.cz

建议	仿生风格,针织物,市场营销,Gviz公司,rtracklayer公司,ggplot2,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学旧金山分校hg38,测试那个,字符串,斯特林吉
链接到	卢比,伯克希尔哈撒韦(>= 1.78.0)
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	pqsfinder_2.20.0.tar.gz
Windows二进制	pqsfinder_2.20.0.zip文件
macOS二进制（x86_64）	pqsfinder_2.20.0.tgz公司
macOS二进制（arm64）	pqsfinder_2.20.0.tgz公司
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pqsfinder网址
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/pqsfinder
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/pqsfinder网站/
包短Url	https://bioductor.org/packages/pqsfinder/
软件包下载报告	下载统计信息