plyranges系列

操作GenomicRanges的流畅界面


生物导体版本:释放(3.19)

一个类似dplyr的接口,用于与常见的生物导体类Ranges和GenomicRanges交互。通过提供语法和一致的方式来操作这些类,希望能够增加新Bioconductor用户的可访问性。

作者:斯图亚特·李、迈克尔·劳伦斯[aut,ctb]、戴安娜·库克[aut、ctb]和斯宾塞·奈斯特罗姆[ctb]、皮尔雷·鲍尔·阿希萨[ctb]、迈克尔·洛夫[ctb,cre]

维护人员:迈克尔·洛夫(Michael Love)<michaelisaiahlove at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“plyranges”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“plyranges”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“plyranges”)
介绍 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 新闻报道,数据表示,基础设施,软件,工作流步骤
版本 1.24.0
在生物导体中 生物技术3.7(R-3.5)(6.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.5),生物遗传学,I范围(>= 2.12.0),基因组范围(>= 1.28.4)
进口 方法,数字播放器,爱尔兰航空公司(>= 0.2.0),马格里特,潮汐选择(>= 1.0.0),rtracklayer公司,基因组比对,基因组信息Db,Rsamtools软件,S4载体(>=0.23.10),实用工具
系统要求
统一资源定位地址
Bug报告 https://github.com/tidyomics/plyranges网站
查看更多
建议 针织物,生物风格,rmarkdown公司,测试那个(>= 2.1.0),HelloRanges(HelloRange),Hello范围数据,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,pasillaBamSubset系列,冠状病毒,ggplot2
链接到
增强功能
取决于我
导入我 BOBaFIT公司,BUSpaRse公司,cfDNAPro公司,少女,基因组图,InPAS公司,卡特探测器,水手,甲基CC,多棱镜,nearBynding公司,空范围,绘图员,交互作用,SARC公司,潮汐学,fluent基因组学,摩卡
建议我 额外ChIP,模因,svaNUMT公司,svaRetro公司,tidyCoverage公司,CTCF公司
指向我的链接
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 量程_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 plyranges_1.24.0.zip码
macOS二进制(x86_64) plyranges1.24.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plyranges网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/包裹
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/plyranges网址/
包短Url https://bioconductor.org/packages/plyranges网站/
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