现象测试

以高效、结构化、快速和可扩展的方式测试基因表达和表型之间关联的工具。我们还提供了进行GSEA（基因集富集分析）和拷贝数变异的工具。

生物导体版本：释放（3.19）

以高效、结构化、快速和可扩展的方式测试基因表达和表型之间相关性的工具。还提供GSEA。

作者：Evarist星球

维护人员：Evarist Planet（Evarist.Planet at epfl.ch）

引文（从R中输入引文（“现象测试”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“现象测试”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“现象测试”）

phenTest库手册	PDF格式	R脚本
参考手册	PDF格式

生物视图	分类,群集,差异表达式,微阵列,多重比较,软件
版本	1.52.0
在生物导体中	生物C 2.8（R-2.13）（13年）
许可证	GPL（>=2）
取决于	R（>=3.6.0），博科生物、方法、，注释,希特普卢斯,BMA公司,ggplot2,Hmisc公司
进口	生存,利马,gplots（gplots）,类别,注释Dbi,霍帕赫,生物反应器,GSEA基础,基因过滤器,xtable的,注释,管理现金流量,hgu133a.db公司,椭圆
系统要求
统一资源定位地址

建议	GSEA基础,政府.db
链接到
增强功能	平行，组织机构代码.db,组织管理例会.db,组织Rn.eg.db,组织Hs.eg.db,组织Dm.eg.db
取决于我
导入我	取消
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	现象测试_1.52.0.tar.gz
Windows二进制	phenTest_1.52.0.zip
macOS二进制（x86_64）	现象测试_1.52.0.tgz
macOS二进制（arm64）	现象测试_1.52.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phenoTest
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/现象测试
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/penoTest网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/phenoTest网站/
软件包下载报告	下载统计信息