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pgxRpi(磅/平方英寸)

Progenetix的R包装


生物导体版本:释放(3.19)

该包是基于Beacon v2协议构建的Progenetix REST API的R包装器。其目的是提供一种从Progenetix数据库检索基因组数据的无缝方式,Progenetix数据库是一个专门用于策划癌基因图谱的开放资源。通过此软件包,用户可以轻松访问和可视化来自Progenetix的数据。

作者:赵杭嘉[aut,cre],迈克尔·鲍迪斯

维护人员:赵杭嘉<赵杭嘉在uzh.ch>

引文(从R中输入引文(“pgxRpi”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“pgxRpi”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“pgxRpi”)
简介_1_加载元数据 HTML格式 R脚本
简介_2_负载变体 HTML格式 R脚本
简介_3_加载频率 HTML格式 R脚本
简介_4_process_pgxseg HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 副本编号变化,数据导入,基因组变异,软件
版本 1.0.2
在生物导体中 生物C 3.19(R-4.4)(<6个月)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.2)
进口 utils、方法、grDevices、图形、,绕圈子,高温气冷堆,数字播放器,尝试,杂交的,生存,监督员,ggplot2,普利尔,基因组范围,总结性实验,S4载体,平行地
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/progenetix/pgxRpi
错误报告 https://github.com/progenetix/pgxRpi/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 pgxRpi_1.0.2.目标.gz
Windows二进制 pgxRpi_1.0.2.zip文件
macOS二进制(x86_64) pgxRpi_1.0.2.tgz(磅/平方英寸)
macOS二进制(arm64) pgxRpi_1.0.2.tgz(磅/平方英寸)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pgxRpi
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/pgxRpi
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/pgxRpi/
包短Url https://bioconductor.org/packages/pgxRpi/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源代码包 源存档