pfam分析仪
pfam数据中结构域同型的识别
生物导体版本：释放（3.19）
蛋白质域是我们拥有的最重要的蛋白质注释之一，而Pfam数据库/工具是（迄今为止）最常用的工具。这个R包使用户能够从Web服务器和独立运行到R中读取pfam预测。我们最近显示，大多数人类蛋白质结构域以多个不同的变体存在，称为结构域同型。不同的结构域异构体用于细胞、组织和疾病特定的方式。因此，我们发现结构域同型相比较，可以调节或消除蛋白质结构域的功能。这个R包可以从Pfam数据中识别和分类这种结构域同型。
作者：克里斯托弗·维廷·塞鲁普[cre，aut]
维护人员：Kristoffer Vitting-Seerup<k.Vitting.Seerup at gmail.com>
引文（从R中输入引文（“pfamAnalyzeR”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“pfamAnalyzeR”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“pfamAnalyzeR”）
细节
| 生物视图 |
交替拼接,注释,生物医学信息学,数据导入,功能基因组学,功能预测,基因预测,软件,系统生物学,转录体变体 |
| 版本 |
1.4.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.17（R-4.3）（1.5年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.3.0），阅读器,字符串,数字播放器 |
| 进口 |
实用程序，易怒的,马格里特 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
|
| Bug报告 |
https://github.com/kvittingseerup/pfamAnalyzeR/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
