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峰值脉冲

高分辨率实验的峰值拾取与注释


生物导体版本:释放(3.19)

用于检测、集成和报告大量质谱数据文件中预定义特征的自动化管道。它支持在单个文件中实时注释多个化合物,或在多个文件中并行注释多个复合物。图形用户界面和命令行功能将有助于评估注释的质量并更新拟合参数,直到获得满意的结果。

作者:阿诺·沃尔夫[aut,cre],Goncalo Correia[aut]、杰克·皮尔斯、卡罗琳·桑兹

维护人员:阿诺德·沃尔弗(Arnaud Wolfer)

引文(从R中输入引文(“peakPather”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“峰值温度”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“peakPather”)
peakPather包入门 HTML格式 R脚本
平行注释 HTML格式 R脚本
peakPantheR图形用户界面 HTML格式 R脚本
实时注释 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 质谱学,代谢组学,峰值检测,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 生物技术3.10(R-3.6)(4.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.2)
进口 foreach公司(>= 1.4.4),do并行(>= 1.0.11),ggplot2(>= 3.5.0),额外网格(>= 2.3),M数据库(>= 2.4.0),毫兹罗(>= 2.12.0),字符串(>=1.2.0),方法(>=3.4.0),XML格式(>= 3.98.1.10),最小包装.lm(>= 1.2.1),规模(>= 0.5.0),闪亮的(>= 1.0.5),bslib数据库,小贩(>= 1.0.0),DT公司(>= 0.15),普拉克马(>=2.2.3),实用程序,杂交的,斯格利特(>= 2.1.1)
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/phenmecentre/peakPather(https://github.com/penmecenter/peakAnther)
错误报告 https://github.com/phenmecentre/peakPathR/issues/new
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 峰值Ther_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 峰值Ther_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64) 峰值Ther_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/peakPantheR网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/峰值温度
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/peakPather网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/peakPather网站/
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