packFinder（包查找器）

包装型转座元件的从头注释

生物导体版本：释放（3.19）

用于硅包内转座子发现的算法和工具。过滤给定基因组中DNA转座子特有的属性，并提供用于调查返回匹配项的工具。序列以DNAString格式输入，范围作为数据帧返回（以as.dataframe（GRanges）返回的格式）。

作者：杰克·吉斯比，马可·卡托尼[aut]

维护人员：杰克·吉斯比（Jack Gisby at gmail.com）

引文（从R中输入引文（“packFinder”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“packFinder”）

对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignets（“packFinder”）

生物视图	注释,遗传学,序列匹配,软件
版本	1.16.0
在生物导体中	生物柴油3.11（R-4.0）（4年）
许可证	GPL-2型
取决于	R（>=4.1.0）
进口	生物串,基因组范围，kmer，ape，方法，I范围,S4矢量
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/jackgisby/packFinder网站
错误报告	https://github.com/jackgisby/packFinder/issues

建议	biomartr、knitr、rmarkdown、testtat、dendextend、，生物视图,生物检测,仿生风格
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	packFinder_1.16.0.tar.gz包查找器
Windows二进制	packFinder_1.16.0.zip包查找器
macOS二进制（x86_64）	packFinder_1.16.0.tgz包查找器
macOS二进制（arm64）	packFinder_1.16.0.tgz包查找器
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/packFinder网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/packFinder
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/packFinder网站/
程序包短Url	https://bioconductor.org/packages/packFinder/
软件包下载报告	下载统计信息