正位体

`正交是使用条件变分自动编码器进行方差分解的R包

生物导体版本：释放（3.19）

`orthos将RNA-seq对比物分解为非特异性和实验特异性成分，例如从基因敲除或复合治疗实验中获得的对比物。原始对比度和分解对比度可以根据大型对比度数据库（源自ARCHS4，https://maayanlab.cloud/archs4网站/)以确定类似的实验`orthos还提供了绘图功能，以可视化类似对比度搜索的结果。

作者：帕帕赛卡斯泛球虫[aut，cre]夏洛特·索内森，迈克尔·斯塔德勒[aut]，弗里德里希·米歇生物医学研究所

维护人员：帕帕赛卡斯（Panagiotis Papasaikas）

引文（从R中输入引文（“正交”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“正交”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“正交图”）

1.矫形器简介	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

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细节

生物视图	差异表达式,基因表达式,RNA序列,软件
版本	1.2.0
在生物导体中	生物C 3.18（R-4.3）（1年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.3），总结性实验
进口	批注中心,蛇怪,生物并行,色彩空间,奶牛场,DelayedArray（延迟阵列）,数字播放器,实验中心,ggplot2,ggpubr公司,gg排斥,ggsci公司，gr设备，网格，HDF5阵列,珊瑚礁，方法，正交数据，平行，胶合板,网状的,爱尔兰航空公司,S4载体，统计，张量流,三年
系统要求
统一资源定位地址

建议	生物管理器,仿生风格,html工具,针织者,市场营销,测试那个(>= 3.0.0)
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	正交-1.2.0.tar.gz
Windows二进制	orthos_1.2.0.zip
macOS二进制（x86_64）	正交-1.2.0.tgz
macOS二进制（arm64）	正交-1.2.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/orthos网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/正交
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/othos网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/orthos网站/
软件包下载报告	下载统计信息