开放细胞

流式细胞术数据的分层门控管道


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包旨在以顺序方式促进自动选通方法,以模仿手动选通策略。

作者:Mike Jiang、John Ramey、Greg Finak、Raphael Gottardo

维护人员:Mike Jiang(迈克在ozette网站)

引文(从R中输入引文(“openCyto”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“openCyto”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“openCyto”)
openCyto包简介 HTML格式 R脚本
如何使用不同的自动选通功能 HTML格式 R脚本
如何编写csv门控模板 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 数据导入,数据表示,流式细胞术,免疫肿瘤学,预处理,软件
版本 2.16.1
在生物导体中 生物技术2.13(R-3.0)(11年)
许可证 仅AGPL-3.0
取决于 R(>=3.5.0)
进口 方法,博科生物,生物遗传学,flowCore(流动堆芯)(>= 1.99.17),流Viz,ncdfFlow(ncdf流量)(>= 2.11.34),流工作区(>= 3.99.1),flowClust(流动俱乐部)(>= 3.11.4),苏格兰皇家银行,图表,数据表,R彩色啤酒
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 流工作空间数据,针织物,市场营销,降价,测试那个,utils,工具,并行,ggcyto细胞,细胞ML,流量统计信息(>= 4.5.2),MASS(质量)
链接到 cpp11型,伯克希尔哈撒韦
增强功能
取决于我
导入我 细胞ML
建议我 催化剂,flowClust(流动俱乐部),flowCore(流动堆芯),流量统计信息,flowTime(流动时间),流工作区,ggcyto细胞
指向我的链接
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 开放细胞_2.16.1.tar.gz
Windows二进制 openCyto_2.16.1.zip(打开细胞_2.16.1.zip)
macOS二进制(x86_64) 开放细胞_2.16.1.tgz
macOS二进制(arm64) 开放细胞_2.16.1.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/openCyto
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/openCyto
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/openCyto网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/openCyto/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源代码包 源存档