个体过程

解剖本体、细胞系等的处理


生物导体版本:释放(3.19)

支持获取不同的生物信息本体,特别是使用CRAN上的本体索引包。我们提供有关细胞、细胞系、化合物和解剖学的关键本体的快照,以帮助分析基因组规模的实验,尤其是细胞x化合物屏幕。另一个目的是加强开发引人注目的用例,以便为新兴本体提供更丰富的接口。

作者:文森特·凯里,萨拉·斯坦基维茨

维护人员:文森特·凯里在channing.harvard.edu>

引文(从R中输入引文(“ontoProc”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“ontoProc”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignette(“ontoProc”)
ontoProc:一些面向本体的实用程序,用于Bioconductor的单细胞聚焦 HTML格式 R脚本
owlents:在ontoProc中直接使用OWL HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 GO(开始),基础设施,软件
版本 1.26.4
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(7年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.0),本体索引
进口 博科生物,S4载体,方法,统计,实用程序,生物文件缓存,闪亮的,图表,Rgraphviz公司,本体论图,数字播放器,马格里特,DT公司,记录仪,批注中心,总结性实验,网状的,R.utils公司,高温气冷堆
系统要求 猫头鹰2
统一资源定位地址 https://github.com/vjcitn/ontoProc
Bug报告 https://github.com/vjcitn/ontoProc/issues
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建议 针织物,组织Hs.eg.db,组织管理例会.db,测试那个,生物风格,单细胞实验,细胞索引,rmarkdown公司,注释Dbi,魔法
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 本体程序_1.26.4.tar.gz
Windows二进制 ontoProc_1.26.4.zip
macOS二进制(x86_64) 本体程序_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) 本体程序_1.26.4.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ontoProc
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ontoProc
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ontoProc/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ontoProc/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包 源存档