核素R

R的核小体定位包


生物导体版本:释放(3.19)

平铺阵列和NGS实验的核小体定位。

作者:奥斯卡·弗洛雷斯,里卡德·伊拉

维护人员:阿尔巴萨拉

引文(从R中输入引文(“nucleR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“nucleR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“nucleR”)
Vignette标题 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 ChIPSeq公司,新闻报道,数据导入,遗传学,微阵列,核小体定位,质量控制,排序,软件
版本 2.36.0
在生物导体中 BioC 2.9(R-2.14)(13年)
许可证 LGPL(>=3)
取决于 R(>=3.5.0),方法
进口 博科生物,生物遗传学,生物串,基因组信息Db,基因组范围,I范围,Rsamtools软件,S4载体,短读,数字播放器,ggplot2,马格里特,并行,stats,utils,grDevices
系统要求
统一资源定位地址
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 核素R_2.36.0.tar.gz
Windows二进制 nucleR_2.36.0.zip核
macOS二进制(x86_64) 核素R_2.36.0.tgz
macOS二进制(arm64) 核素R_2.36.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nucleR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:程序包/nucleR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/nucleR/
包短Url https://bioconductor.org/packages/nucleR/
软件包下载报告 下载统计信息