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mz标识

用于R的mzIdentML解析器


生物导体版本:释放(3.19)

使用XML包实现的mzIdentML文件的解析器。该解析器尽量通用,能够处理所有类型的mzIdentML文件,但其缺点是与特定于供应商的解析器相比,输出“漂亮”得少。如有任何问题,请联系维护人员,并提供mzIdentML文件,以便快速修复问题。

作者:劳伦·加托[ctb,cre],托马斯·佩德森[aut],弗拉迪斯拉夫·佩特尤克

维护人员:劳伦特·加托在uclouvane.be>

引文(从R中输入引文(“mzID”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“mzID”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“mzID”)
使用mzID PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据导入,免疫肿瘤学,质谱学,蛋白质组学,软件
版本 1.42.0
在生物导体中 生物技术2.13(R-3.0)(10.5年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 方法
进口 XML格式,普利尔,平行,do并行,foreach公司,迭代器,前遗传学
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 针织物,测试那个
链接到
增强功能
取决于我
导入我 M数据库,MSnID(MSnID),目标诱饵
建议我 毫兹罗,PS匹配,蛋白质组学研究
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 mzID_1.42.0.tar.gz
Windows二进制 mzID_1.42.0.zip码
macOS二进制(x86_64) mzID_1.42.0.tgz
macOS二进制(arm64) mzID_1.42.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mzID
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/mzID
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse-mzID/
包短Url https://bioconductor.org/packages/mzID/
软件包下载报告 下载统计信息