ms输入

无标签质谱肽的插补


生物导体版本:释放(3.19)

MsImpute是一个用于在蛋白质组学实验中插补肽强度的软件包。它还包含用于MAR/MNAR诊断和评估数据插补后概率分布失真的工具。如果缺失值是MAR(method=“v2”),则通过底层数据矩阵的低阶近似值进行插补;如果缺失值为MNAR(“v2-MNAR”),那么通过重心法进行插补,或者通过肽身份传播(PIP)进行插补。

作者:索洛尔·赫迪耶赫扎德[aut,cre]

维护人员:Soroor Hediyeh-zadeh<位于wehi.edu.au的hediyehzadeh.s>

引文(从R中输入引文(“msImpute”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“msImpute”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“msImpute”)
msImpute:蛋白质组学缺失值插补和诊断 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 质谱学,蛋白质组学,软件
版本 1.14.0
生物柴油3.12(R-4.0)(4年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 R(>=3.5.0)
进口 softImpute软件,方法,统计,图形,个人数据表,网状的,尖叫声,数据表,FNN公司,矩阵统计,利马,mvtnorm公司,第三年,数字播放器
系统要求 蟒蛇
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/DavisLaboratory/msImpute/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 msImpute_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 msImpute_1.14.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) msImpute_1.14.0.tgz
macOS二进制(arm64) msImpute_1.14.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msImpute网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ms生效
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/msImpute网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/msImpute网站/
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