ms输入
无标签质谱肽的插补
生物导体版本:释放(3.19)
MsImpute是一个用于在蛋白质组学实验中插补肽强度的软件包。它还包含用于MAR/MNAR诊断和评估数据插补后概率分布失真的工具。如果缺失值是MAR(method=“v2”),则通过底层数据矩阵的低阶近似值进行插补;如果缺失值为MNAR(“v2-MNAR”),那么通过重心法进行插补,或者通过肽身份传播(PIP)进行插补。
作者:索洛尔·赫迪耶赫扎德[aut,cre]
维护人员:Soroor Hediyeh-zadeh<位于wehi.edu.au的hediyehzadeh.s>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“msImpute”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“msImpute”)
细节
生物视图 |
质谱学,蛋白质组学,软件 |
版本 |
1.14.0 |
自 |
生物柴油3.12(R-4.0)(4年) |
许可证 |
GPL(>=2) |
取决于 |
R(>=3.5.0) |
进口 |
softImpute软件,方法,统计,图形,个人数据表,网状的,尖叫声,数据表,FNN公司,矩阵统计,利马,mvtnorm公司,第三年,数字播放器 |
系统要求 |
蟒蛇 |
统一资源定位地址 |
|
错误报告 |
https://github.com/DavisLaboratory/msImpute/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。