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马赛克

MOSAiCS(基于MOdel的ChIP-Seq一、二样本分析和推断)


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包提供了拟合MOSAiCS和MOSAiCS-HMM的功能,这是一个统计框架,用于分析转录因子结合和组蛋白修饰的单样本或双样本ChIP-seq数据。

作者:钟东军、裴芬宽、雷内·韦尔奇、桑杜斯·凯尔斯

维护人员:钟东军<gmail.com>

引文(从R中输入引文(“马赛克”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“马赛克”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignette(“马赛克”)
MOSAiCS公司 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 生物信息学,ChIPseq公司,遗传学,排序,软件,转录
版本 2.42.0
在生物导体中 生物C 2.8(R-2.13)(13年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 R(>=3.0.0),方法,图形,卢比
进口 MASS(质量)、花键、,晶格,I范围,基因组范围,基因组比对,Rsamtools软件,基因组信息Db,S4载体
系统要求 波尔
统一资源定位地址 http://groups.google.com/group/mosaics_user_group
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 马赛克_2.42.0.tar.gz
Windows二进制 马赛克_2.42.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 马赛克_2.42.0.tgz
macOS二进制(arm64) 马赛克_2.42.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosaics网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/马赛克
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/mosaics网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/mosaics网站/
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