移动RNA
mobileRNA：研究RNA流动团和人口规模的变化
生物导体版本：释放（3.19）
基因组分析可用于确定两种条件下RNA种群之间的差异，包括产量和丰度。这包括识别生物系统中多个基因组产生的RNA。例如，宿主内病原体产生的RNA或植物嫁接系统中的移动RNA。mobileRNA软件包提供了一种方法，在同时将读取结果映射到所有基因型的前提下，对sRNA和mRNA群体进行预处理、分析和可视化。
作者：凯蒂·杰恩斯·库珀[aut，cre]
，马可·卡托尼[aut]
维护人员：凯蒂·杰恩斯·库珀（Katie Jeynes-Cupper）<kej031 at student.bham.ac.uk>
引文（从R中输入引文（“mobileRNA”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“mobileRNA”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览Vignets（“移动RNA”）
细节
| 生物视图 |
对齐,群集,实验设计,基因组组装,预处理,质量控制,RNA序列,排序,小RNA,软件,可视化,工作流步骤 |
| 版本 |
1.0.11 |
| 在生物导体中 |
生物活性碳3.19（R-4.4）（<6个月） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.3.0） |
| 进口 |
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| 系统要求 |
GNU制造、ShortStack（>=4.0）、HTSeq、HISAT2、SAMtools、Conda |
| 统一资源定位地址 |
|
| 错误报告 |
https://github.com/KJeynesCapper/mobileRNA/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
