雾状R
多视图细胞间空间建模框架
生物导体版本：释放（3.19）
mistyR是多视图细胞间空间建模框架（MISTy）的一个实现。MISTy是一个可解释的机器学习框架，用于单单元、高度复用、空间分辨率数据的知识提取和分析。MISTy通过分析细胞内和细胞间的关系，有助于深入了解标记物的相互作用。MISTy是一个灵活的框架，能够处理自定义数量的视图。这些视图中的每一个都可以描述不同的空间背景，即定义所观察到的标记表达之间的关系，例如细胞内调节或旁分泌调节，而且这些视图还可以捕获细胞类型特定的关系，捕捉功能足迹之间的关系或关注不同解剖区域之间的关系。每个MISTy视图都被认为是测量的标记表达中变异性的潜在来源。然后分析每个MISTy视图对每个标记的总表达的贡献，并根据与导致观察到贡献的其他测量值的交互作用进行解释。
作者：约万·塔内夫斯基[cre，aut]
，里卡多·奥马尔·拉米雷斯-弗洛雷斯（Ricardo Omar Ramirez Flores），菲利普·谢弗
维护人员：约万·塔内夫斯基（Jovan Tanevski）在uni-heidelberg.de>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“mistyR”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“mistyR”）
细节
| 生物视图 |
生物医学信息学,细胞生物学,决策树,回归,单个单元格,软件,空间,系统生物学 |
| 版本 |
1.12.0 |
| 在生物导体中 |
生物化学3.13（R-4.1）（3年） |
| 许可证 |
GPL-3型 |
| 取决于 |
R（>=4.0） |
| 进口 |
断言,插入符号,德尔迪尔,消化,距离,数字播放器(>= 1.1.0),文件锁定,毛皮商(>= 0.2.0),ggplot2、方法、，呜呜声,护林员,阅读器(>= 2.0.0),脊,爱尔兰航空公司,rlist公司,R.utils公司，统计，字符串,易怒的,第三年,潮汐选择（>=1.2.0），实用程序，用r |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://saezlab.github.io/mistyR网站/ |
| 错误报告 |
https://github.com/saezlab/mistyR/issues |
查看更多
| 建议 |
仿生风格,覆盖（covr）,地球,未来,记录仪(>= 1.2.7),国际货币联盟,内核实验室,针织物,MASS（质量）,rmarkdown公司,RSNNS公司,测试那个(>= 3.0.0),xgboost公司 |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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生成报告 |
程序包档案
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