米纳
微生物群落分布与网络分析
生物导体版本：释放（3.19）
在快速发展的测序技术的帮助下，生成并分析了越来越多的微生物组数据集。目前，分类剖析数据的分析主要是使用基于合成的方法进行的，这忽略了社区成员之间的交互作用。除此之外，缺乏有效的方法来比较微生物相互作用网络，限制了对群落动力学的研究。为了更好地了解群落多样性如何受到其成员之间复杂相互作用的影响，我们开发了一个框架（微生物群落多样性和网络分析，mina），这是一个用于微生物群落多样性分析和网络比较的综合框架。通过定义和集成网络衍生的社区特征，我们大大降低了用于多样性分析的信噪比。实现了一种基于bootstrap和置换的方法，以统计原理评估社区网络的差异性并提取区分特征。
作者：Rui Guan[aut，cre]、Ruben Garrido Oter[ctb]
维护人员：Rui Guan<关在mpipz.mpg.de>
安装
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如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“mina”）
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文档
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细节
| 生物视图 |
软件,工作流步骤 |
| 版本 |
1.12.0 |
| 在生物导体中 |
生物化学3.13（R-4.1）（3年） |
| 许可证 |
GPL公司 |
| 取决于 |
R（>=4.0.0） |
| 进口 |
方法、统计信息、，卢比,MCL公司,R光谱,ap集群,大存储器,foreach公司,ggplot2，平行，平行距离,重塑2,普利尔,大型分析,字符串,Hmisc公司，实用程序 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
|
| 错误报告 |
https://github.com/Guan06/mina网站 |
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程序包档案
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