微生物资源管理器
微生物组探索应用程序
生物导体版本：释放（3.19）
MicrobiomeExplorer R软件包旨在促进标记基因调查特征数据的分析和可视化。它允许用户通过命令行或包中包含的交互式Shiny应用程序执行和可视化典型的微生物组分析工作流程。除了应用通用分析工作流外，该应用程序还支持自动生成分析报告。
作者：Joseph Paulson〔aut〕，Janina Reeder〔aut，cre〕，Mo Huang〔aut〕，基因泰克〔cph，fnd〕
维护人员：贾妮娜·瑞德（Janina Reeder）<reederj1 at gene.com>
引文（从R中输入引文（“microbiomeExplorer”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）生物管理器：：安装（“微生物浏览器”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览Vignets（“微生物浏览器”）
细节
| 生物视图 |
分类,群集,差异表达式,遗传变异性,免疫肿瘤学,基因组,微生物组,多重比较,规范化,排序,软件,可视化 |
| 版本 |
1.14.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.12（R-4.0）（4年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
闪亮的,马格里特,宏基因组eq,博科生物 |
| 进口 |
闪耀（shinyjs）(>= 2.0.0),闪亮的仪表板,小贩,闪亮小工具,rmarkdown公司(>= 1.9.0),设计2,R彩色啤酒,数字播放器,第三年,呜呜声,爱尔兰航空公司,针织物,阅读器,DT公司(>= 0.12.0),生物格式、工具、，字符串,素食主义者,矩阵统计,热图上的,汽车,扫帚,利马,重新整形2,易怒的,对于猫,杂交的、方法、，巧妙地(>= 4.9.1) |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
