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迈阿维兹

微生物组分析绘图和可视化


生物导体版本:发布(3.19)

miaViz包实现了可视化TreeSummarizedExperiment对象的功能,特别是在微生物组分析的上下文中。R/生物导体封装mia系列的一部分。

作者:托马斯·博尔曼[aut,cre],Felix G.M.Ernst[aut],利奥·拉赫蒂[aut],巴兹尔·库巴耶[ctb],朱利奥·贝内德蒂[ctb]

维护人员:Tuomas Borman<Tuomas.v.Borman at utu.fi>

引文(从R中输入引文(“miaViz”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“miaViz”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“miaViz”)
迈阿维兹 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 微生物组,软件,可视化
版本 1.12.0
在生物导体中 生物化学3.13(R-4.1)(3年)
许可证 Artistic-2.0 |文件许可证
取决于 R(>=4.0),总结性实验,树总结实验,贫血(>=0.99),ggplot2,gggraph(>=2.0)
进口 方法、统计信息、,S4载体,生物遗传学,生物并行,DelayedArray(延迟阵列),散射,ggtree公司,ggnewscale,viridis,tibble,tidytree,tidygraph,rlang,purrr,tidyr,dplyr,猿,Dirichlet多项式,gg排斥,单细胞实验
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 迈阿维兹_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 迈阿密Viz_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64) 迈阿维兹_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64) 迈阿维兹_1.12.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miaViz
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miaViz
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse-miaViz/
包短Url https://bioconductor.org/packages/miaViz/
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