迈阿西姆

微生物组数据模拟

生物导体版本：释放（3.19）

利用广义Lotka-Volterra模型、自组织不稳定性（SOI）和其他模型进行微生物组时间序列模拟。Hubbell的中性模型用于确定丰度矩阵。得到的丰度矩阵应用于（树）摘要实验对象。

作者：雅格穆尔·西姆塞克[cre，aut]，卡罗琳·浮士德[aut]、于高[aut'、艾玛·盖森[aut]]、丹尼尔·里奥斯·加尔扎[aut】、托马斯·博尔曼[aut]，Leo Lahti[奥特]

维护人员：Yagmur Simsek<gmail.com上的Yagmur.Simsek.98>

引文（从R中输入引文（“miaSim”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“miaSim”）

对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“miaSim”）

生物视图	ATACSeq公司,新闻报道,DNASeq公司,微生物组,网络,排序,软件
版本	1.10.0
在生物导体中	生物柴油3.14（R-4.1）（2.5年）
许可证	Artistic-2.0 \|文件许可证
取决于	树状总结实验
进口	总结性实验，解算，统计，功率定律，矩阵泛型,S4载体
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/microbiome/miaSim网站
错误报告	https://github.com/microbiome/miaSim/issues网站

建议	类人猿，集群，foreach，doParallel，dplyr，GGally，ggplot2，igraph，网络，重塑2，sna，素食，rmarkdown，knitr，仿生风格，测试，米娅,迈阿维兹、颜色值、Phillentropy
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	迈阿密_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	miaSim_1.10.0.zip软件
macOS二进制（x86_64）	迈阿西姆_1.10.0.tgz
macOS二进制（arm64）	迈阿西姆_1.10.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miaSim网址
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/miaSim
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/miaSim网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/miaSim网站/
软件包下载报告	下载统计信息