米娅

微生物组分析

生物导体版本：释放（3.19）

mia基于SummaredExperiment、SingleCellExperiment和TreeSummarizedExperiment基础设施实现微生物组分析工具。分类数据中的数据争论和分析是主要范围。实现了常见任务的附加功能，如社区指数计算和汇总。

作者：费利克斯·G·M·恩斯特[aut]，Sudarshan A.Shetty[作者]，托马斯·博尔曼[aut，cre]，Leo Lahti[奥特]、杨操、内森·D·奥尔森、列维·沃尔德龙、马塞尔·拉莫斯、赫克托尔·科拉达·布拉沃、贾亚拉姆·坎切拉、多梅尼克·布拉西娅、巴兹尔·库拜尔、穆卢·穆卢赫

维护人员：Tuomas Borman<Tuomas.v.Borman at utu.fi>

引文（从R中输入引文（“mia”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“mia”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“mia”）

米娅	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

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细节

生物视图	数据导入,微生物组,软件
版本	1.12.0
在生物导体中	生物化学3.13（R-4.1）（3年）
许可证	Artistic-2.0 \|文件许可证
取决于	R（>=4.0），总结性实验,单细胞实验,树总结实验(>= 1.99.3),多重分析实验
进口	方法、stats、utils、MASS、ape、，去塔姆、素食主义者、，生物遗传学,S4载体,I范围,生物管柱,DECIPHER公司,生物并行,延迟阵列,延迟矩阵统计,舷窗,散射,Dirichlet多项式、rlang、dplyr、tibble、tidyr、，咆哮,矩阵泛型
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/microbiome/mia
错误报告	https://github.com/microbiome/mia/issues

建议	测试，编织，拼凑，仿生风格、山药、，品学兼优,数据2，字符串，生物格式、reldist、ade4、，微生物数据集、rmarkdown
链接到
增强功能
取决于我	迈阿维兹
导入我	ANCOMBC公司,管理的宏基因组数据,达尔,MGnifyR公司
建议我	CBEA公司,迈阿西姆,微生物基准数据,菲尔
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	迈阿密_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	mia_1.12.0.zip格式
macOS二进制（x86_64）	迈阿密_1.12.0.tgz
macOS二进制（arm64）	迈阿密_1.12.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mia
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包装/mia
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse-mia/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/mia/
软件包下载报告	下载统计信息