宏基因组eq
稀疏高通量测序的统计分析
生物导体版本：释放（3.19）
metagenomeSeq旨在确定两组或多组多个样本之间差异丰富的特征（无论是操作分类单元（OTU）、物种等）。metagenomeSeq旨在解决微生物群落归一化和欠采样对疾病关联检测和特征相关性测试的影响。
作者：Joseph Nathaniel Paulson、Nathan D.Olson、Domenick J.Braccia、Justin Wagner、Hisham Talukder、Mihai Pop、Hector Corrada Bravo
维护人员：约瑟夫·保尔森（Joseph N.Paulson）
引文（从R中输入引文（“metagenomeSeq”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“metagenomeSeq”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“metagenomeSeq”）
细节
| 生物视图 |
分类,群集,差异表达式,遗传变异性,免疫肿瘤学,基因组,微生物组,多重比较,规范化,排序,软件,可视化 |
| 版本 |
1.46.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术2.12（R-3.0）（11年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=3.0），博科生物,利马,格尔姆奈特、方法、，R彩色啤酒 |
| 进口 |
平行，矩阵统计,foreach公司,矩阵,gplots（gplots），图形，grDevices，stats，utils，扳手 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/nosson/metagenomeSeq网站/ |
| 错误报告 |
https://github.com/nosson/metagenomeSeq/issues网站 |
查看更多
| 建议 |
注释,生物遗传学,生物格式,针织物,全球供应链,测试那个(>= 0.8),素食主义者,交互式显示,IHW公司 |
| 链接到 |
|
| 增强功能 |
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| 取决于我 |
微生物资源管理器,十六进制 |
| 导入我 |
钳形的,马斯林2,最小数量,微生物DASim,微生物标记,ggpicrust2,MetaLonDA公司 |
| 建议我 |
达尔,交互式显示,品学兼优,scTreeViz软件,扳手 |
| 指向我的链接 |
|
| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
