卢米
用于Illumina甲基化和表达微阵列的BeadArray特异性方法
生物导体版本：释放（3.19）
lumi软件包为Illumina微阵列数据分析提供了一个集成解决方案。它包括Illumina BeadStudio（GenomeStudio）数据输入、质量控制、BeadArray-specific方差稳定、归一化和探针水平的基因注释功能。它还包括处理Illumina甲基化微阵列的功能，尤其是Illuminia Infinium甲基化微阵。
作者：潘杜、理查德·鲍根、刚峰、西蒙·林
维护人员：黄磊<lhuang1998在gmail.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“lumi”）
对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.
文件
细节
| 生物视图 |
DNA甲基化,微阵列,一个频道,预处理,质量控制,软件,双通道 |
| 版本 |
2.56.0 |
| 在生物导体中 |
BioC 2.0（R-2.5）（17年） |
| 许可证 |
LGPL（>=2） |
| 取决于 |
R（>=2.10），博科生物(>= 2.5.5) |
| 进口 |
阿菲(>= 1.23.4),甲基脲(>= 2.3.2),基因组特征,基因组范围,注释，晶格，mgcv（>=1.4-0），nleqslv，KernSmooth，预处理核心、RSQLite、DBI、，注释Dbi，MASS，图形，统计，统计4，方法 |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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查看更多
| 建议 |
beadarray公司,利马,vsn（vsn）,卢米·巴恩斯,lumi全人类.db,lumiHumanID映射,基因过滤器、R彩色啤酒 |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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阵列Mvout,ffpe公司,MineICA公司 |
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生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
