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利姆卡

基于ASCA/APCA方法族的高维设计数据线性建模R包


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包旨在为高维设计数据提供一种建立线性模型的方法。limpca应用ASCA和APCA的GLM(通用线性模型)版本来分析实验设计生成的多元样本曲线。ASCA/APCA为与实验设计相关的统计模型的每个效应空间中的多元结构提供了强大的可视化工具,与MANOVA相反,它可以处理变量多于观测值的多变量数据集。这种方法可以处理不平衡的设计。

作者:伯纳黛特·戈瓦茨[aut,ths],塞巴斯蒂安·弗朗西斯科尼[ctb],罗宾·范·欧贝克[ctb].米歇尔·泰尔[aut],帕斯卡尔·德图利奥[dtc],马诺·马丁[aut、cre],娜迪娅·贝奈切

维护人员:马诺·马丁(Manon Martin)

引文(从R中输入引文(“limpca”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“limpca”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“limpca”)
用limpca分析鳟鱼数据集 HTML格式 R脚本
使用limpca分析UCH数据集 HTML格式 R脚本
开始使用limpca HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 实验设计,基因表达式,代谢组学,多重比较,主要组件,回归,软件,统计方法,可视化
版本 1.0.0
在生物导体中 生物活性碳3.19(R-4.4)(<6个月)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.5.0)
进口 ggplot2,字符串,普利尔,gg排斥,重塑2,gr设备,图形,do并行,平行,数字播放器,易怒的,第三年,ggsci公司,潮韵诗,方法,统计信息,总结性实验,S4载体
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/ManonMartin/limpca网站 https://manonmartin.github.io/limpca网站/
错误报告 https://github.com/ManonMartin/limpca/issues网站
查看更多
建议 仿生风格,迎合者,rmarkdown公司,汽车,额外网格,针织物,测试那个(>= 3.0.0)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 跛行_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 limpca_1.0.0.zip
macOS二进制(x86_64) limpca_1.0.0.tgz
macOS二进制(arm64) limpca_1.0.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/limpca
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/limpca
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/limpca/
包短Url https://bioconductor.org/packages/limpca/
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