." /> 生物导体-idpr

注册打开对于生物2024
提前注册折扣定价将于5月31日结束!

国际数据保护协会

R基因内禀紊乱蛋白质的分析


生物导体版本:释放(3.19)

“idpr”旨在集成工具,用于对R内的固有无序蛋白质(IDPs)进行计算分析。该软件包用于识别IDPs的已知特征,以获得易于报告的动态结果。此外,该软件包还包括与其他R软件包一起使用的基于IDP的序列分析工具。McFadden WM和Yanowitz JL(2022)中进行了描述。“idpr:一种用于分析R中本质无序蛋白质的软件包。”PloS one,17(4),e0266929。.

作者:William M.McFadden【cre,aut】、Judith L.Yanowitz【aut,fnd】、Michael Buszczak【ctb,fnd)

维护人员:威廉·麦克法登(William M.McFadden)<wmm27 at pitt.edu>

引文(从R中输入引文(“idpr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“idpr”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文件

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“idpr”)
电荷和水疗渐晕 HTML格式 R脚本
无序矩阵Vignette HTML格式 R脚本
idpr包概述小品 HTML格式 R脚本
IUPred小品 HTML格式 R脚本
序列图渐晕 HTML格式 R脚本
结构趋势渐晕图 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 细胞生物学,蛋白质组学,软件,结构预测
版本 1.14.0
在生物导体中 生物柴油3.12(R-4.0)(3.5年)
许可证 LGPL(>=3)
取决于 R(>=4.1.0)
进口 ggplot2(>=3.3.0),magrittr(>=1.5),dplyr(>=0.8.5),plyr(>=1.8.6),jsonlite(>=1.6.1),rlang(>=0.4.6),生物串(>=2.56.0),方法(>=4.0.0)
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/wmm27/idpr/issues网站
查看更多
建议 knitr、rmarkdown、,pwalling(pwallign),海事处、猿、测试、序列
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 idpr_1.14.0.tar.gz号
Windows二进制 idpr_1.14.0.zip文件(仅64位)
macOS二进制(x86_64) idpr_1.14.0.tgz号
macOS二进制(arm64) idpr_1.14.0.tgz号
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/idpr
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/idpr
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/idpr/
包短Url https://bioconductor.org/packages/idpr/
软件包下载报告 下载统计信息