爱马仕
RNA-seq数据的预处理、分析和报告
生物导体版本：释放（3.19）
为预处理的“RNA-seq”数据的质量控制、过滤、规范化和差异表达分析提供类和函数。数据可以从“SummarizedExperience”和“matrix”对象导入，也可以从“BioMart”进行注释。支持筛选表达量不太低或包含所需注释的基因，以及筛选与其他样本或读取总数有足够相关性的样本。可以使用标准的归一化方法，包括cpm、rpkm和tpm，并且可以使用“DESeq2”和voom差异表达分析。
作者：Daniel Sabanés Bové[aut，cre]，Namrata Bhatia[aut]，Stefanie Bienert[aut'，Benoit Falquet[aut]]，Haocheng Li[aut4]，Jeff Luong[aut]，Lyndsee Midori Zhang[aut〕，Alex Richardson[autneneneea，Simona Rossomanno[aut】，Tim Treis[aut2]，Mark Yan[autneneneei，Naomi Chang[au]，Chendi Liao[aut;]，Carolyn Zhang（aut]），Joseph N.Paulson[aut），F。Hoffmann La Roche股份有限公司
维护人员：Daniel Sabanés Bové<Daniel.sabanes_bove-at-rconis.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“hermes”）
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文档
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细节
| 生物视图 |
差异表达式,规范化,预处理,质量控制,RNA序列,软件 |
| 版本 |
1.8.1 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.15（R-4.2）（2.5年） |
| 许可证 |
Apache许可证2.0 |
| 取决于 |
gg强化，R（>=4.1），总结性实验(>= 1.16) |
| 进口 |
断言,博科生物,生物遗传学,生物反应器,将死(>= 2.1),绕圈子,复杂热图,设计2,数字播放器,边缘R,环境统计,对于猫(>= 1.0.0),基因组范围,ggplot2,gg排斥(>= 0.9),I范围,生命周期,利马,马格里特,矩阵统计、方法、，多重分析实验,呜呜声,R6级,Rdpack公司,拉朗,S4载体，统计，第三年，实用程序 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/insightsenengineering/hermes网站/ |
| 错误报告 |
https://github.com/insightsenengineering/hermes/issues |
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程序包档案
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