全球测试

测试与响应变量关联的协方差组/特征,并应用于基因集测试


生物导体版本:释放(3.19)

全局测试测试一组协变量(或特征)与响应变量的关联。该软件包使用诊断图和多个测试实用程序实现了测试,并提供了几个功能,以便于将该测试用于GO和KEGG术语的基因集测试。

作者:Jelle Goeman和Jan Oosting,以及Livio Finos、Aldo Solari和Dominic Edelmann的贡献

维护人员:杰尔·戈曼(Jelle Goeman)<j.j.Goeman at lumc.nl>

引文(从R中输入引文(“globaltest”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“全局测试”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“全球测试”)
全局测试 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 生物信息学,差异表达式,GO(开始),微阵列,一个频道,路径,软件
版本 5.58.0
在生物导体中 BioC 1.6(R-2.1)或更早(>19.5年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 方法,生存
进口 博科生物,注释Dbi,注释,图形
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 vsn(vsn),golubEsets公司,KEGGREST公司,胡6800.db,Rgraphviz公司,政府.db,lung表达式,组织Hs.eg.db,GSEA基地,受到惩罚的,全球供应链,MASS(质量),靴子,r零件,m状态
链接到
增强功能
取决于我 GlobalAncova公司
导入我 业务连续性,EGSEA公司,SIM卡,miR测试,SlaPMEG公司
建议我 顶部GO,GiANT公司,受到惩罚的
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 全球测试5.58.0.tar.gz
Windows二进制 全球测试_5.58.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 全球测试5.58.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/globaltest网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/globaltest
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/globaltest网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/globaltest网站/
软件包下载报告 下载统计信息