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ggtree额外

在“ggtree”的圆形或其他布局树上添加几何层的R包


生物导体版本:释放(3.19)

“ggtreeExtra”扩展了使用“ggtree”在系统发育树上映射和可视化关联数据的方法。这些相关数据可以在外部面板上显示为圆形布局、扇形布局或其他由“ggtree”构建的矩形布局树,语法为“ggplot2”。

作者:徐双斌[aut,cre],Guanghuang Yu[aut,ctb]

维护人员:徐双斌<xshuangbin at 163.com>

引文(从R中输入引文(“ggtreeExtra”))以下为:

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ggtreeExtra”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“ggtreeExtra”)
ggtree额外 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 注释,系统发育学,软件,可视化
版本 1.14.0
在生物导体中 生物柴油3.12(R-4.0)(3.5年)
许可证 GPL(>=3)
取决于
进口 ggplot2,实用程序,爱尔兰航空公司,gg新闻量表,统计,ggtree公司,潮树(>= 0.3.9),克莱,马格里特
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/YuLab-SMU/ggtreeExtra网站/
错误报告 https://github.com/YuLab-SMU/ggtreeExtra/issues网站
查看更多
建议 树(treeio),ggstar公司,拼凑,针织者,rmarkdown公司,美女医生,降价,测试那个(>= 3.0.0),支柱
链接到
增强功能
取决于我
导入我 微生物菌剂工艺
建议我 浓缩图,ggmsa,个人所得税
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 ggtree附加_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 ggtree附加_1.14.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) ggtree附加_1.14.0.tgz
macOS二进制(arm64) ggtree附加_1.14.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggtreeExtra网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ggtreeExtra
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ggtreeExtra网址/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ggtreeExtra网站/
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