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ggkegg公司

通过ggplot2实现KEGG路径可视化


生物导体版本:释放(3.19)

该包旨在导入、解析和分析KEGG数据,如KEGG PATHWAY和KEGG MODULE。该软件包通过使用图形语法,支持使用ggplot2和gggraph可视化KEGG信息。该软件包可以直接可视化各种组学分析软件包的结果。

作者:佐藤北宫[cre,aut]

维护人员:佐藤诺丽(Noriaki Sato)<hgc.jp>

引文(从R中输入引文(“ggkegg”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ggkegg”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“ggkegg”)
格格 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 数据导入,KEGG公司,路径,软件
版本 1.2.1
在生物导体中 生物柴油3.18(R-4.3)(0.5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.3.0),ggplot2,gggraph图,XML格式,记录仪,潮汐记录仪
进口 生物文件缓存,GetoptLong(获取长),数据表,数字播放器,魔法,拼凑,阴影文本,字符串,易怒的,组织Hs.eg.db,方法,实用程序,统计信息,注释Dbi,gr设备,gtable表
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/noriakis/ggkegg
错误报告 https://github.com/noriakis/ggkegg/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 ggkegg_1.2.1.tar.gz型
Windows二进制 ggkegg_1.2.1.zip码(仅64位)
macOS二进制(x86_64) ggkegg_1.2.1.tgz
macOS二进制(arm64) ggkegg_1.2.1.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggkegg网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ggkegg
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/gggeg/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ggkegg/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源代码包 源存档