基因质体

同源群的进化和可塑性分析

生物导体版本：释放（3.19）

基因质体是根据给定物种树中的直系群分布进行进化和可塑性分析的。它使用香农信息理论和正交丰度来估计演化塑性指数。此外，它还实现了Bridge算法，以根据给定基因的直系分布确定其进化根。

作者：罗德里戈·达尔莫林、毛罗·卡斯特罗

维护人员：毛罗·卡斯特罗（Mauro Castro）<Mauro.a.Castro at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“geneplast”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）生物管理器：：安装（“geneplast”）

对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“geneplast”）

生物视图	基因调控,遗传学,软件,系统生物学
版本	1.30.0
在生物导体中	生物C 3.4（R-3.3）（7.5年）
许可证	GPL（>=2）
取决于	R（>=4.0），方法
进口	igraph、snow、ape、grDevices、图形、统计数据、utils、data.table
系统要求
统一资源定位地址

建议	RTN公司、RUnit、，生物遗传学,仿生风格、knitr、rmarkdown、，弗莱彻2013b,geneplast.数据,geneplast.data.string.v91、ggplot2、ggpubr、plyr
链接到
增强功能
取决于我
导入我	geneplast.数据
建议我	geneplast.数据,树和叶子
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	基因质体_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	geneplast_1.30.0.zip
macOS二进制（x86_64）	基因质体_1.30.0.tgz
macOS二进制（arm64）	基因质体_1.30.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geneplast
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/geneplast
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/geneplast/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/geneplast网站/
软件包下载报告	下载统计信息