日内瓦

乳腺癌基因表达特征的计算


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包包含执行基因表达分析通常需要的各种任务的功能,特别是在乳腺癌研究中:不同微阵列平台之间的基因映射、分子亚型的识别、已发布基因签名的实现、基因选择和生存分析。

作者:Deena M.A.Gendoo[aut]、Natchar Ratanasirigulchai[aut'、Markus S.Schroeder[aut]、Laia Pare[aut】、Joel S Parker[aut)、Aleix Prat[au]、Nikta Feizi[ctb]、Christopher Eeles[ctb]、Benjamin Haibe-Kains[aut,cre]

维护人员:本杰明·海贝-凯恩斯(Benjamin Haibe.Kains)

引文(从R中输入引文(“基因”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“genefu”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览小品(“genefu”)
genefu:乳腺癌基因表达分析软件包 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 分类,群集,差异表达式,基因表达式,软件,可视化
版本 2.36.0
在生物导体中 生物技术2.8(R-2.13)(13.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.1),survcomp公司,生物电阻,iC10,目的
进口 阿玛普,插补,麦克卢斯特,利马,图形,统计,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 http://www.pmgenomics.ca/bhklab/software/genefu
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链接到
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取决于我
导入我 同意OV,PDATK(掌上电脑)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 通用2.36.0.tar.gz
Windows二进制 genefu_2.36.0.zip系列
macOS二进制(x86_64) 通用2.36.0.tgz
macOS二进制(arm64) 基因频率2.36.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genefu
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/genefu
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/genefu网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/genefu网站/
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