基因过滤器

genefilter:高通量实验中筛选基因的方法


生物导体版本:释放(3.19)

筛选基因的一些基本功能。

作者:Robert Gentleman[aut]、Vincent J.Carey[aut]、Wolfgang Huber[aut)、Florian Hahne[aut'、Emmanuel Taiwo[ctb](从Swave到RMarkdown/HTML.的“howtogenefinder”渐晕图翻译)、Khadijah Amusat[ctb](从swave转换为RMarkdown/HTML.的基因过滤器渐晕图)、生物导体包维护器[cre]

维护人员:Bioconductor Package Maintainer<维护人员在Bioconductor.org>

引文(从R中输入引文(“genefilter”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“genefilter”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“genefilter”)
03-附加图:独立过滤增加了检测差异表达基因的能力,Bourgon等人,PNAS(2010) PDF格式 R脚本
howtogenefinder.knit服装 HTML格式 R脚本
使用基因过滤器功能从微阵列中筛选基因 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 微阵列,软件
版本 1.86.0
在生物导体中 BioC 1.6(R-2.1)或更早(>19.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于
进口 矩阵泛型(>= 1.11.1),注释Dbi,注释,博科生物,图形,方法,统计,生存,gr设备
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 ,hgu95av2.db型,tk小工具,所有,世界车王争霸赛,R彩色啤酒,仿生风格,针织物
链接到
增强功能
取决于我 单元格HTS2,CNTools(CNTools),基因Meta,特别行政区,Hiiragi 2013年,maEnd到End,rnaseq基因,lmQCM公司
导入我 a4底座,annmap(自动地图),阵列质量指标,类别,cbaf公司,类别R,countsimQC(计数质量控制),冠状病毒RNA,DEXSeq公司,GSRI公司,亚eqR2,甲基CC,甲基脲,米菲,ML接口,莫格萨,NBAMSeq公司,pca浏览器,PECA公司,表型试验,protGear公司,SGCP公司,空间热图,拼接向导,平铺数组,XDE公司,锌波,流式排序。鲜血。史诗般的,IHW纸,RNA相互作用MAPK,CoNI公司,dG销售ID,INCATome公司,MiDA公司,netgsa公司
建议我 注释,生物网络,类别比较,集群Stab,代码链路,可乐,编码器,DelayedArray(延迟阵列),强化热图,事实设计,ffpe公司,基因组文件,GOstats公司,GSAR公司,GSEAlm公司,GSVA公司,HDF5阵列,逻辑FS,卢米,MMUPHin公司,npGSEA公司,寡聚物,品学兼优,聚醋酸乙烯酯,qp图,无线电跟踪器,西格涅斯,简单丰富,TCG生物链,topGO(顶GO),血癌多功能2017,管理的膀胱数据,管理的CRC数据,管理的卵巢数据,雌激素,ffpe示例数据,量具数据,MAQ子集,蛋白质组学研究,风湿ConditionWollbold,单一.mTEC。转录组,maGUI(主图形用户界面),onc预测,超级学习者
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 发电机过滤器_1.86.0.tar.gz
Windows二进制 通用过滤器_1.86.0.zip
macOS二进制(x86_64) 发电机过滤器_1.86.0.tgz
macOS二进制(arm64) 发电机过滤器_1.86.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genefilter网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/genefilter
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/genefilter网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/genefilter网站/
软件包下载报告 下载统计信息