双子座

双子座:从成对CRISPR筛查推断遗传交互作用的变异推理方法


生物导体版本:释放(3.19)

GEMINI使用对数变换来建模样本依赖和独立效应,并使用变分贝叶斯方法来推断这些效应。推断的效应用于评分和识别遗传交互作用,如致死率和恢复率。更多细节见Zamanighomi等人2019年(新闻稿)。

作者:Mahdi Zamanighomi[aut]、Sidharth Jain[aut、cre]

维护人员:西德哈特·贾恩(Sidharth Jain)

引文(从R中输入引文(“双子座”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“双子座”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“双子座”)
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新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 贝叶斯,CRISPR公司,数据导入,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 生物C 3.10(R-3.6)(5年)
许可证 BSD_3_clause+文件许可证
取决于 R(>=4.1.0)
进口 数字播放器,gr设备,ggplot2,马格里特,混合工具,规模,pbmcapply公司,并行,统计,实用程序
系统要求
统一资源定位地址
Bug报告 https://github.com/sellerslab/gemini/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 双子座_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 双子座_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64) 双子座_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64) 双子座_1.18.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gemini
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:套餐/双子座
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/gemini网站/
包短Url https://bioductor.org/packages/gemini/
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