关贸总协定

在原子转移网络中寻找活性代谢模块

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包实现了代谢网络分析管道，以基于高通量数据识别活跃的代谢模块。该管道将转录和/或代谢数据作为输入，并找到在两种感兴趣的条件之间最受调节的代谢子网络（模块）。该包还提供模块后处理、注释和可视化功能。

作者：阿纳斯塔西亚·盖努利纳[aut]、玛丽亚·埃梅利亚诺娃[aut]:Alexey Sergushichev[aut，cre]

维护人员：Alexey Sergushichev<gmail.com上的alsergbox>

引文（从R中输入引文（“gatom”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“gatom”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“gatom”）

使用gatom包	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式

生物视图	差异表达式,基因表达式,网络,路径,软件
版本	1.2.0
在生物导体中	生物柴油3.18（R-4.3）（0.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.3.0）
进口	数据表，图表，生物网络，plyr，methods，XML，sna，intergraph，network，GGally，grid，ggplot2，mwcsr，pryr，htmlwidgets，htmltools，shinyCyJS（>=1.0.0）
系统要求
网址	https://github.com/ctlab/gatom网站/
错误报告	https://github.com/ctlab/gatom/issues

建议	测试，针织者，rmarkdown，KEGGREST公司,注释Dbi,组织管理例会.db,反应.db,fgsea公司，读卡器，仿生风格，R.utils公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
链接到我
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	关贸总协定1.2.0.tar.gz
Windows二进制	gatom_1.2.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	gatom_1.2.0.tgz
macOS二进制（arm64）	gatom_1.2.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gatom网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/gatom
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/gatom网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/gatom网站/
软件包下载报告	下载统计信息