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fenr公司

交互式应用程序的快速功能丰富


生物导体版本:释放(3.19)

使用超几何分布对特征列表(如基因或蛋白质)执行快速功能丰富。该软件包专为速度量身定制,是Shiny等交互式平台的理想选择。它支持从GO、KEGG、Reactome、Bioplanet和WikiPathways等来源检索功能数据。通过首先下载和准备数据,它允许对各种功能选择进行快速连续测试,而无需重复、耗时的准备步骤,这是其他软件包的典型特征。

作者:马雷克·吉尔林斯基[aut,cre]

维护人员:马雷克·吉尔林斯基(Marek Gierlinski)

引文(从R中输入引文(“fenr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“fenr”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“fenr”)
快速功能充实 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 差异表达式,功能预测,GO(开始),GeneSet扩展,KEGG公司,蛋白质组学,反应途径,软件
版本 1.2.1
在生物导体中 生物柴油3.18(R-4.3)(0.5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.1.0)
进口 工具、方法、,断言,爱尔兰航空公司,数字播放器,第三年,潮汐选择,易怒的,呜呜声,阅读器,字符串,高温气冷堆2,服务器,进步,生物文件缓存,闪亮的,ggplot2
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/bartongroup/fenr
错误报告 https://github.com/bartongroup/fenr/issues网站
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建议 仿生风格,测试那个,针织物,rmarkdown公司,topGO(顶GO)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 分_1.2.1.tar.gz
Windows二进制 fenr_1.2.1.zip文件
macOS二进制(x86_64) 围栏_1.2.1.tgz
macOS二进制(arm64) 围栏_1.2.1.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fenr
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/围栏
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/fenr/
包短Url https://bioconductor.org/packages/fenr/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源代码包 源存档