fedup公司

Fisher用户定义路径的丰富和枯竭测试

生物导体版本：释放（3.19）

使用Fisher精确测试测试用户定义路径的富集和耗尽的R包。该方法是为通用路径注释格式（例如gmt、txt、xlsx）设计的，允许用户对自定义注释运行路径分析。该软件包还与Cytoscape集成，以提供基于网络的路径可视化，从而增强结果的可解释性。

作者：凯瑟琳·罗斯

维护人员：凯瑟琳·罗斯<catherinem.Ross at mail.utoronto.ca>

引文（从R中输入引文（“fedup”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“fedup”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“fedup”）

生物视图	GeneSet扩展,网络,网络扩展,路径,软件
版本	1.12.0
在生物导体中	生物柴油3.13（R-4.1）（3.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.1）
进口	开放式xlsx,易怒的,数字播放器,数据表,ggplot2,ggthemes主题,预测,R彩色啤酒,RCy3号机组，实用程序，统计
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/rosscm/fedup
错误报告	https://github.com/rosscm/fedup/issues网站

建议	生物反应器,第三年,测试那个,针织者,rmarkdown公司,开发工具,覆盖（covr）
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	fedup_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	联邦快递_1.12.0.zip
macOS二进制（x86_64）	fedup_1.12.0.tgz
macOS二进制（arm64）	fedup_1.12.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fedup
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/fedup
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/fedup/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/fedup/
软件包下载报告	下载统计信息