epiNEM公司
epiNEM公司
生物导体版本:释放(3.19)
epiNEM是原始嵌套效应模型(NEM)的扩展。EpiNEM能够考虑双重淘汰并推断更复杂的网络信号通路。它是为大型双敲屏量身定制的。
作者:Madeline Diekmann和Martin Pirkl
维护人员:马丁·皮尔克尔<雅虎的马丁皮尔克尔>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“epiNEM”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“epiNEM”)
细节
生物视图 |
网络,网络推理,路径,软件,系统生物学 |
版本 |
1.28.0 |
在生物导体中 |
生物碳3.5(R-3.4)(7.5年) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=4.1) |
进口 |
BoolNet公司,e1071号,gtools公司,统计,记录仪,实用程序,晶格,额外格子,R彩色啤酒,pcalg公司,地雷,gr设备,图表,记忆,最晚2个月 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/cbg-ethz/epiNEM/ |
错误报告 |
https://github.com/cbg-ethz/epiNEM/issues网站 |
查看更多
建议 |
针织物,RUnit(运行单位),生物遗传学,字符串db,开发工具,rmarkdown公司,GOSemSim公司,批注中心,组织S.c.sgd.db,仿生风格 |
链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
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导入我 |
bnem公司,dce公司,尼姆皮 |
建议我 |
记忆 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。