浓缩图
函数丰富结果的可视化
生物导体版本：释放（3.19）
“enrichplot”包实现了几种可视化方法，用于解释从ORA或GSEA分析中获得的功能富集结果。它主要设计用于与“clusterProfiler”软件包套件配合使用。所有可视化方法都是基于“ggplot2”图形开发的。
作者：余光创[aut，cre]
，高春晖[ctb]
维护人员：Guanghuang Yu（广创语）
引文（从R中输入引文（“enrichplot”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“enrichplot”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“enrichplot”）
细节
| 生物视图 |
注释,GO（开始）,GeneSet扩展,KEGG公司,路径,软件,可视化 |
| 版本 |
1.24.4 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.7（R-3.5）（6.5年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=3.5.0） |
| 进口 |
大量(>= 0.2.1),剂量(>= 3.16.0),ggfun公司(>= 0.1.3),gg新闻量表,ggplot2,gggraph图，图形，网格，记录仪、方法、，普利尔,呜呜声,R彩色啤酒,重新整形2,爱尔兰航空公司，统计，实用程序，散乱的,阴影文本,GOSemSim公司,马格里特,ggtree（ggtree）,尤拉布·乌利斯(>= 0.0.8) |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book/ |
| Bug报告 |
https://github.com/GuangchuangYu/enrichplot/issues |
查看更多
| 建议 |
clusterProfiler（群集探查器）,数字播放器,欧洲人民运动会,gg翻转,针织物,rmarkdown公司,组织Hs.eg.db,美女医生,易怒的,第三年,gg力,注释Dbi,ggplotify（图形化）,ggridges公司，gr设备，额外网格,gg排斥(>= 0.9.0),ggstar公司,规模,ggtree额外,潮间带 |
| 链接到 |
|
| 增强功能 |
|
| 取决于我 |
maEnd到End |
| 导入我 |
CBN图,ChIP寻求者,clusterProfiler（群集探查器）,清理机,enrichViewNet,MAGECK稀释液,网格,微生物剖面仪,反应omePA,基于TD的UFEadv,ExpHunter套件,TOmicsVis公司 |
| 建议我 |
GeoTcga数据,马斯特R,甲基GSA,帕雷格,ReporterScore报告分数,SC发布 |
| 指向我的链接 |
|
| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
