差异(diffcyt)
高分辨率聚类在高维细胞术中的差异发现
生物导体版本:释放(3.19)
基于高分辨率聚类和改编自转录组学的经验Bayes调节测试的组合,在高维细胞术数据(包括流式细胞术、大规模细胞术或CyTOF和寡核苷酸标记细胞术)中进行差异发现分析的统计方法。
作者:卢卡斯·韦伯[aut,cre]
维护人员:卢卡斯·韦伯(Lukas M.Weber)<lmweberedu at gmail.com>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“diffcyt”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“diffcyt”)
细节
生物视图 |
基于细胞的分析,细胞生物学,群集,特征提取,流式细胞术,免疫肿瘤学,蛋白质组学,单个单元格,软件 |
版本 |
1.24.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.7(R-3.5)(6.5年) |
许可证 |
MIT+文件许可证 |
取决于 |
R(>=3.4.0) |
进口 |
flowCore(流动堆芯),FlowSOM公司,总结性实验,S4载体,利马,边缘R,lme4公司,多计算机,数字播放器,第三年,重新整形2,马格里特、stats、methods、utils、grDevices、graphics、,复杂热图,绕圈子,网格 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/lmweber/diffcyt网址 |
Bug报告 |
https://github.com/lmweber/diffcyt/issues(网址:https://github.com/lmweber/diffcyt/issues) |
查看更多
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。