细胞核
基于核的分数测试的差异表达
生物导体版本:释放(3.19)
cytoKernel实现了基于核的分数测试,以识别高维生物实验中差异表达的特征。这种方法可以应用于许多不同的高维生物数据,包括基因表达数据和基于降维细胞术的标记表达数据。在这个R包中,我们实现了计算特征线p值及其相应的调整p值的函数。此外,它还计算按特征缩小的效果大小及其相应的缩小效果大小。此外,它计算差异表达特征的百分比,并绘制行上顶部差异表达特征和列上样本的用户友好热图。
作者:Tusharkanti Ghosh[aut,cre],Victor Lui[aut],Pratyaydipta Rudra[aut',Souvik Seal[aut].Thao Vu[aut],Elena Hsieh[au],Debashis Ghosh[aut,cph]
维护人员:Tusharkanti Ghosh<tusharkantighosh30 at gmail.com>
引文(从R中输入引文(“cytoKernel”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“cytoKernel”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“细胞核”)
细节
生物视图 |
群集,差异表达式,流式细胞术,基因表达式,免疫肿瘤学,一个频道,蛋白质组学,单个单元格,软件 |
版本 |
1.10.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.14(R-4.1)(3年) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=4.1) |
进口 |
卢比,总结性实验,实用程序,方法,复杂热图,绕圈子,灰烬,数据表,生物并行,数字播放器,统计,马格里特,爱尔兰航空公司,S4载体 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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Bug报告 |
https://github.com/Ghoshlab/cytoKernel/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。