十字形的

微阵列数据的跨平台元分析

生物导体版本：释放（3.19）

对Affymentrix、Illumina和Agilent微阵列数据进行跨平台和跨物种的元分析。该软件包自动化了诸如下载、规范化和注释原始GEO数据等常见任务。然后，用户选择对照和治疗样本，以便对所有比较进行差异表达分析。在分别分析每个对比度后，用户可以为每个对比度选择组织来源，并指定应分组用于后续荟萃分析的任何组织来源。

作者：亚历克斯·皮克林

维护人员：亚历克斯·皮克林<alexvpickering在gmail.com>

引文（从R中输入引文（“crossmeta”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“crossmeta”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“crossmeta”）

交叉渐晕	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
许可证	文本

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细节

生物视图	注释,BatchEffect（批次效果）,差异表达式,图形用户界面,基因表达式,微阵列,一个频道,预处理,软件,组织微阵列,转录
版本	1.30.0
在生物导体中	生物C 3.4（R-3.3）（7.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.0）
进口	阿菲(>= 1.52.0),affxparser软件(>= 1.46.0),注释Dbi(>= 1.36.2),博科生物(>= 2.34.0),生物遗传学(>= 0.20.0),生物管理器(>= 1.30.4),DT公司(>= 0.2),数据库接口(>= 1.0.0),数据表(>= 1.10.4),边缘R,氟多醇(>= 1.2.15),地理查询(>= 2.40.0),利马(>= 3.30.13),矩阵统计(>= 0.51.0),metaMA公司(>= 3.1.2),迷你用户界面（>=0.1.1），方法，寡聚物(>= 1.38.0),读者(>= 1.0.6),RCurl（RCurl）(>= 1.95.4.11),RSQ网站(>= 2.1.1),字符串(>= 1.2.0),特别行政区(>= 3.22.0),闪亮的(>= 1.0.0),闪亮的牛仔裤(>= 2.0.0),闪亮BS(>= 0.61),闪亮小工具(>= 0.5.3),胫骨板(>= 0.1.0),易怒的,XML格式(>= 3.98.1.17),读xl(>= 1.3.1)
系统要求	libxml2:libxml2-dev（deb），libxml2-devel（rpm）libcurl:libcurl4 openssl dev（deb），libcurl-devel（rpm）openssl:libssl dev（deb），openssl devel（rpm），libssl_dev（csw），openssl@1.1版本（酿造）
统一资源定位地址	https://github.com/alexvpickering/crossmeta
错误报告	https://github.com/alexvpickering/crossmeta/issues网站

建议	针织物,rmarkdown公司,lydata公司,组织Hs.eg.db,测试那个
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我	ccmap（ccmap）
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	十字形_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	crossmeta_1.30.0.zip
macOS二进制（x86_64）	十字形_1.30.0.tgz
macOS二进制（arm64）	十字形_1.30.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/crossmeta
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/crossmeta
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/crossmeta网址/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/crossmeta/
软件包下载报告	下载统计信息