康西卡

共识独立成分分析


生物导体版本:释放(3.19)

consICA实施了一种数据驱动的反褶积方法——一致性独立成分分析(ICA),以分解异构组学数据并提取适合患者诊断和预测的特征。该方法将生物相关转录信号与技术效应分离,并提供有关细胞组成和生物过程的信息。包中并行计算的实现确保了现代多核系统的高效分析。

作者:彼得·纳扎罗夫[aut,cre],托尼·考马[aut],玛丽娜·切佩列娃[aut]

维护人员:彼得·纳扎罗夫(Petr V.Nazarov)

引文(从R中输入引文(“consICA”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“consICA”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“consICA”)
consICA包:用户手册 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 分类,特征提取,RNA序列,排序,软件,统计方法,技术,转录组学
版本 2.2.0
在生物导体中 生物C 3.16(R-4.2)(2年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.2.0)
进口 fastICA(快速ICA)(>= 1.2.1),平方米,组织Hs.eg.db,政府.db,统计,总结性实验,生物并行,图表,ggplot2、方法、,快速,情势图,生存,topGO(顶GO)、图形、gr设备
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/biomod-lih/consICA/issues
查看更多
建议 针织物,仿生风格,rmarkdown公司,测试那个,修拉
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 消费品_2.2.0.tar.gz
Windows二进制 consICA_2.2.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) 意识_2.2.0.tgz
macOS二进制(arm64) 意识_2.2.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/consICA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/consICA
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/consICA/
包短Url https://bioconductor.org/packages/consICA/
软件包下载报告 下载统计信息