康西卡
共识独立成分分析
生物导体版本:释放(3.19)
consICA实施了一种数据驱动的反褶积方法——一致性独立成分分析(ICA),以分解异构组学数据并提取适合患者诊断和预测的特征。该方法将生物相关转录信号与技术效应分离,并提供有关细胞组成和生物过程的信息。包中并行计算的实现确保了现代多核系统的高效分析。
作者:彼得·纳扎罗夫[aut,cre],托尼·考马[aut],玛丽娜·切佩列娃[aut]
维护人员:彼得·纳扎罗夫(Petr V.Nazarov)
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“consICA”)
对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“consICA”)
细节
生物视图 |
分类,特征提取,RNA序列,排序,软件,统计方法,技术,转录组学 |
版本 |
2.2.0 |
在生物导体中 |
生物C 3.16(R-4.2)(2年) |
许可证 |
MIT+文件许可证 |
取决于 |
R(>=4.2.0) |
进口 |
fastICA(快速ICA)(>= 1.2.1),平方米,组织Hs.eg.db,政府.db,统计,总结性实验,生物并行,图表,ggplot2、方法、,快速,情势图,生存,topGO(顶GO)、图形、gr设备 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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错误报告 |
https://github.com/biomod-lih/consICA/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。