comapr公司

交叉分析与遗传图谱构建


生物导体版本:释放(3.19)

comapr从单体型状态序列中检测单个配子的交叉间隔,并将交叉存储在GRanges对象中。然后,可以使用标记间隔的估计交叉率,通过映射函数计算遗传距离。实现了绘制基于间隔的遗传图或累积遗传距离的可视化功能,这有助于揭示基因组和个体之间交叉景观的变化。

作者:吕汝谦[aut,cre]

维护人员:吕如谦<xiaoru.best at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“comapr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“comapr”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“comapr”)
使用映射器启动 HTML格式 R脚本
单精子共分析 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 遗传学,单个单元格,软件,可视化
版本 1.8.0
生物柴油3.15(R-4.2)(2.5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.1.0)
进口 方法,ggplot2,重塑2,数字播放器,额外网格,巧妙地,使循环,爱尔兰航空公司,基因组学范围,I范围,foreach公司,生物并行,基因组信息数据库,规模,R彩色啤酒,三年,S4载体,实用程序,矩阵,网格,统计,总结性实验,胶合板,Gviz公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 comapr_1.8.0.tar.gz公司
Windows二进制 comapr_1.8.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) comapr_1.8.0.tgz公司
macOS二进制(arm64) comapr_1.8.0.tgz公司
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/comapr
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/comapr
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/comapr/
包短Url https://bioconductor.org/packages/comapr/
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