中国农场

cn.FARMS-拷贝数估计的因子分析

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包实现了拷贝数变化（CNV）分析的cn.FARMS算法。cn.FARMS允许分析最常见的Affymetrix（250K-SNP6.0）阵列类型，支持使用snow和ff进行高性能计算。

作者：安德烈亚斯·米特雷克（Andreas Mitterecker），德约克·阿内·克利夫特（Djork-Arne Clevert）

维护人员：安德烈亚斯·米特雷克（Andreas Mitterecker）

引文（从R中输入引文（“cn.farms”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）生物管理器：：安装（“中国农场”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“cn.farms”）

cn.farms：R包手册	PDF格式	R脚本
参考手册	PDF格式

生物视图	副本编号变化,微阵列,软件
版本	1.52.0
在生物导体中	生物技术2.8（R-2.13）（13.5年）
许可证	LGPL（>=2.0）
取决于	R（>=3.0），博科生物、方法、，ff（关闭）,寡头类,雪
进口	数据库接口,affxparser软件,寡聚物,DNA副本,预处理核心,晶格
系统要求
统一资源定位地址	http://www.bioinf.jku.at/software/cnfarms/cnfarms.html

建议	pd.mapping250k.sty公司,pd.映射250k.nsp,pd.基因组5,pd.全基因组snp.6
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	中国农场_1.52.0.tar.gz
Windows二进制	cn.farms_1.52.0.zip网址
macOS二进制（x86_64）	中国农场_1.52.0.tgz
macOS二进制（arm64）	中国农场_1.52.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cn.farms网址
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/cn.farms
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/cn.farms网址/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/cn.farms（https://bioconductor.org/packages/cn.farms）/
软件包下载报告	下载统计信息